Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q499Y3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q499Y3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms