Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ERCC8Q13216 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms