Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM2Q13029 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM2Q13029 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
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