Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNMA1Q12791 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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