Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC15Q0P6D6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms