Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL16A1Q07092 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL16A1Q07092 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms