Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms