Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63132 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms