Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBX2P52951 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GBX2P52951 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GBX2P52951 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GBX2P52951 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GBX2P52951 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GBX2P52951 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GBX2P52951 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms