Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYF2O95926 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYF2O95926 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYF2O95926 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYF2O95926 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYF2O95926 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms