Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPIPB9F8W1W9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms