Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNMA8BQ9ULN7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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