Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms