Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP25Q9UHP3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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