Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms