Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOMER3Q9NSC5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOMER3Q9NSC5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms