Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
KRTAP2-4Q9BYR9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms