Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CMTM5Q96DZ9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM5Q96DZ9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms