Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLD3Q8IV08 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLD3Q8IV08 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms