Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NHLRC1Q6VVB1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NHLRC1Q6VVB1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms