Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 OR5AR1-201ENST00000624596 1026 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHIC1Q5VXU3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms