Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHSL1Q5SYE7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms