Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL38Q2WGJ6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms