Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR2Q2VWA4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR2Q2VWA4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms