Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TXNRD1Q16881 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms