Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NRF1Q16656 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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NRF1Q16656 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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NRF1Q16656 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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NRF1Q16656 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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NRF1Q16656 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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NRF1Q16656 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NRF1Q16656 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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