Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC37Q16543 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC37Q16543 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms