Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCOA1Q15788 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCOA1Q15788 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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