Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYTH1Q15438 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH1Q15438 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms