Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK3Q13003 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK3Q13003 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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