Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBE1Q04446 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms