Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK16Q00536 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK16Q00536 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms