Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRP9P49458 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRP9P49458 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms