Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FynP39688 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FynP39688 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FynP39688 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FynP39688 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FynP39688 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FynP39688 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FynP39688 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FynP39688 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FynP39688 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FynP39688 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FynP39688 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FynP39688 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FynP39688 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms