Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRMP28827 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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