Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLD1P28340 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLD1P28340 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLD1P28340 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLD1P28340 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms