Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA4O75676 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA4O75676 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms