Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKAP2O75563 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKAP2O75563 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms