Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms