Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VGFO15240 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VGFO15240 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VGFO15240 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VGFO15240 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VGFO15240 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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