Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-2B6SEH9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms