Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP5LA4QPB2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms