Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD54L2Q9Y4B4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD54L2Q9Y4B4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD54L2Q9Y4B4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD54L2Q9Y4B4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms