Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms