Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms