Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMCC3Q9ULS5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms