Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RLIMQ9NVW2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RLIMQ9NVW2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms