Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1BQ9H0U4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAB1BQ9H0U4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms