Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP4Q9C0A0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms