Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD5Q99666 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RGPD5Q99666 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms